Mickaël CANOUIL

Curriculum Vitæ

Expérience

Oct. 2017 --
Présent

Responsable d'Équipe Biostatistique

Laboratoire de Génomique Intégrative et Modélisation des Maladies Métaboliques - UMR 8199 (CNRS / Université de Lille 2 / Institut Pasteur de Lille), Lille, France

Activités: Études d'association pan-génomique, plans d'expériences, études de données "omiques", développements méthodologiques, gestion d'équipe

Dirigé par Pr. P. Froguel
Janv. 2016 --
Sept. 2017

Responsable d'Équipe Biostatistique

Laboratoire de Génomique Intégrative et Modélisation des Maladies Métaboliques - UMR 8199 (CNRS / Université de Lille 2 / Institut Pasteur de Lille), Lille, France

Activités: Études d'association pan-génomique, plans d'expériences, études de données "omiques", développements méthodologiques, gestion d'équipe

Dirigé par Pr. P. Froguel
Sept. 2012 --
Déc. 2015

Biostatisticien

Laboratoire de Génomique Intégrative et Modélisation des Maladies Métaboliques - UMR 8199 (CNRS / Université de Lille 2 / Institut Pasteur de Lille), Lille, France

Activités: Études d'association pan-génomique, plans d'expériences, études de données "omiques", développements méthodologiques

Dirigé par Pr. P. Froguel
Nov. 2011 --
Déc. 2011

Biostatisticien

Institut Francais des Sciences et Technologies des Transports, de l'Amenagement et des Reseaux (IFSTTAR) - UMRESTTE - UMR T9405, Bron, France

Activités: Analyse d’une enquête de mobilité et accident des collégiens

Supervisé par Dr. M. Haddak
Janv. 2011 --
Juin 2011

Biostatisticien (Stage)

Hospices Civiles de Lyon - Service de Biostatistique - UMR CNRS 5558, Lyon, France

Activités: Développement d'un Algorithme de Classification de Données Longitudinales, Non Paramétrique sur le Temps

Supervisé par Pr. R. Ecochard et Dr. C. Genolini
Mars 2010 --
Juin 2010

Biostatisticien (Stage)

Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive (LBBE) - UMR CNRS 5558, Lyon, France

Activités: Modélisation Mathématique des Infections Nosocomiales à Rotavirus en Pédiatrie - Impacts de Mesures de Prévention

Supervisé par Dr. C. Kribs-Zaleta

Formation

Oct. 2014 --
Sept. 2017

Doctorat en Biostatistique

Université de Lille 2, Lille, France

“ Développement et Application de Méthodologies Statistiques pour Etudes Multi-Omiques dans le Diabète de Type 2: Au-delà de l'Ere des Etudes d'Association Pangénomiques ”

Supervisé par Pr. P. Froguel et Dr. G. Rocheleau
Sept. 2009 --
Juill. 2011

Master 2, Santé-Populations: Biostatistique, Bioinformatique, Génome

Spécialité: Biostatistique

Université Claude Bernard Lyon 1, Lyon, France

Sept. 2006 --
Juill. 2009

Licence de Biologie

Spécialité: Biostatistique

Université Claude Bernard Lyon 1, Lyon, France

Compétences Informatiques

Basiques
C, SQL
Intermédiaires
Julia, Lua, Perl, Python, SAS
Avancées
R, LATEX, HTML, css, Markdown

Langues

Français
Langue Maternelle
Anglais
Courant / Capacité Professionnelle Complète
Espagnol
Notions

Publications

Variable Clustering in High-Dimensional Linear Regression: The R Package clere

Loïc Yengo, Julien Jacques, Christophe Biernacki and Mickaël Canouil

The R Journal (2016)

Hepatic DPP4 DNA-Methylation Associates With Fatty Liver

Christian Baumeier*, Sophie Saussenthaler*, Anne Kammel, Markus Jähnert, Luisa Schlüter, Deike Hesse, Mickaël Canouil, Stephane Lobbens, Robert Caiazzo, Violeta Raverdy, François Pattou, Emma Nilsson, Jussi Pihlajamäki, Charlotte Ling, Philippe Froguel, Annette Schürmann and Robert W. Schwenk
*These authors contributed equally to the present study.

Diabetes (2016)

Decreased STARD10 Expression is Associated with Defective Insulin Secretion in Humans And Mice

Gaelle R. Carrat, Ming Hu, Marie-Sophie Nguyen-Tu, Pauline Chabosseau, Kyle Gaulton, Martijn van de Bunt, Afshan Siddiq, Mario Falchi, Matthias Thurner, Mickaël Canouil, Francois Pattou, Isabelle Leclerc, Timothy J. Pullen, Matthew C. Cane, Priyanka Prabhala, William Greenwald, Anke Schulte, Piero Marchetti, Mark Ibberson, Patrick MacDonald, Jocelyn E. Manning Fox, Anna L. Gloyn, Philippe Froguel, Michele Solimena, Mark I. McCarthy and Guy A. Rutter

The American Journal of Human Genetics (2017)

Relationship Between Salivary/Pancreatic Amylase and Body Mass Index: A Systems Biology Approach

Amélie Bonnefond*, Loïc Yengo*, Aurélie Dechaume, Mickaël Canouil, Maxime Castelain, Estelle Roger, Frédéric Allegaert, Robert Caiazzo, Violeta Raverdy, Marie Pigeyre, Abdelilah Arredouani, Jean-Michel Borys, Claire Lévy-Marchal, Jacques Weill, Ronan Roussel, Beverley Balkau, Michel Marre, François Pattou, Thierry Brousseau and Philippe Froguel
*These authors contributed equally to the present study. These authors contributed equally to the present study.

BMC Medicine (2017)

Expression and Functional Assessment of Candidate Type 2 Diabetes Susceptibility Genes Identify Four New Genes Contributing to Human Insulin Secretion

Fatou K Ndiaye*, Ana Ortalli*, Mickaël Canouil*, Marlène Huyvaert, Clara Salazar-Cardozo, Cécile Lecoeur, Marie Verbanck, Valérie Pawlowski, Raphaël Boutry, Emmanuelle Durand, Iandry Rabearivelo, Olivier Sand, Lorella Marselli, Julie Kerr-Conte, Vikash Chandra, Raphaël Scharfmann, Odile Poulain-Godefroy, Piero Marchetti, François Pattou, Amar Abderrahmani, Philippe Froguel and Amélie Bonnefond
*These authors contributed equally to the present study. These authors are co-senior authors on this work.

Molecular Metabolism (2017)

Low-Dose Exposure to Bisphenols A, F and S of Human Primary Adipocyte Impacts Coding and Non-Coding RNA Profiles

Marie Verbanck*, Mickaël Canouil*, Audrey Leloire, Véronique Dhennin, Xavier Coumoul, Loïc Yengo, Philippe Froguel, Odile Poulain-Godefroy
*These authors contributed equally to this work. These authors are co-senior authors on this work.

PLoS ONE (2017)

A Large-Scale Multi-ancestry Genome-wide Study Accounting for Smoking Behavior Identifies Multiple Significant Loci for Blood Pressure

Yun J. Sung*, Thomas W. Winkler*, Lisa de las Fuentes*, Amy R. Bentley*, Michael R. Brown*, Aldi T. Kraja*, Karen Schwander*, Ioanna Ntalla*, Xiuqing Guo, Nora Franceschini, Yingchang Lu, Ching-Yu Cheng, Xueling Sim, Dina Vojinovic, Jonathan Marten, Solomon K. Musani, Changwei Li, Mary F. Feitosa, Tuomas O. Kilpeläinen, Melissa A. Richard, Raymond Noordam, Stella Aslibekyan, Hugues Aschard, Traci M. Bartz, Rajkumar Dorajoo, Yongmei Liu, Alisa K. Manning, Tuomo Rankinen, Albert Vernon Smith, Salman M. Tajuddin, Bamidele O. Tayo, Helen R. Warren, Wei Zhao, Yanhua Zhou, Nana Matoba, Tamar Sofer, Maris Alver, Marzyeh Amini, Mathilde Boissel, Jin Fang Chai, Xu Chen, Jasmin Divers, Ilaria Gandin, Chuan Gao, Franco Giulianini, Anuj Goel, Sarah E. Harris, Fernando Pires Hartwig, Andrea R.V.R. Horimoto, Fang-Chi Hsu, Anne U. Jackson, Mika Kähönen, Anuradhani Kasturiratne, Brigitte Kühnel, Karin Leander, Wen-Jane Lee, Keng-Hung Lin, Jian ’an Luan, Colin A. McKenzie, He Meian, Christopher P. Nelson, Rainer Rauramaa, Nicole Schupf, Robert A. Scott, Wayne H.H. Sheu, Alena Stančáková, Fumihiko Takeuchi, Peter J. van der Most, Tibor V. Varga, Heming Wang, Yajuan Wang, Erin B. Ware, Stefan Weiss, Wanqing Wen, Lisa R. Yanek, Weihua Zhang, Jing Hua Zhao, Saima Afaq, Tamuno Alfred, Najaf Amin, Dan Arking, Tin Aung, R. Graham Barr, Lawrence F. Bielak, Eric Boerwinkle, Erwin P. Bottinger, Peter S. Braund, Jennifer A. Brody, Ulrich Broeckel, Claudia P. Cabrera, Brian Cade, Yu Caizheng, Archie Campbell, Mickaël Canouil, Aravinda Chakravarti, The CHARGE Neurology Working Group, Ganesh Chauhan, Kaare Christensen, Massimiliano Cocca, The COGENT-Kidney Consortium, Francis S. Collins, John M. Connell, Renée de Mutsert, H. Janaka de Silva, Stephanie Debette, Marcus Dörr, Qing Duan, Charles B. Eaton, Georg Ehret, Evangelos Evangelou, Jessica D. Faul, Virginia A. Fisher, Nita G. Forouhi, Oscar H. Franco, Yechiel Friedlander, He Gao, The GIANT Consortium, Bruna Gigante, Misa Graff, C. Charles Gu, Dongfeng Gu, Preeti Gupta, Saskia P. Hagenaars, Tamara B. Harris, Jiang He, Sami Heikkinen, Chew-Kiat Heng, Makoto Hirata, Albert Hofman, Barbara V. Howard, Steven Hunt, Marguerite R. Irvin, Yucheng Jia, Roby Joehanes, Anne E. Justice, Tomohiro Katsuya, Joel Kaufman, Nicola D. Kerrison, Chiea Chuen Khor, Woon-Puay Koh, Heikki A. Koistinen, Pirjo Komulainen, Charles Kooperberg, Jose E. Krieger, Michiaki Kubo, Johanna Kuusisto, Carl D. Langefeld, Claudia Langenberg, Lenore J. Launer, Benjamin Lehne, Cora E. Lewis, Yize Li, Lifelines Cohort Study, Sing Hui Lim, Shiow Lin, Ching-Ti Liu, Jianjun Liu, Jingmin Liu, Kiang Liu, Yeheng Liu, Marie Loh, Kurt K. Lohman, Jirong Long, Tin Louie, Reedik Mägi, Anubha Mahajan, Thomas Meitinger, Andres Metspalu, Lili Milani, Yukihide Momozawa, Andrew P. Morris, Thomas H. Mosley Jr., Peter Munson, Alison D. Murray, Mike A. Nalls, Ubaydah Nasri, Jill M. Norris, Kari North, Adesola Ogunniyi, Sandosh Padmanabhan, Walter R. Palmas, Nicholette D. Palmer, James S. Pankow, Nancy L. Pedersen, Annette Peters, Patricia A. Peyser, Ozren Polasek, Olli T. Raitakari, Frida Renström, Treva K. Rice, Paul M. Ridker, Antonietta Robino, Jennifer G. Robinson, Lynda M. Rose, Igor Rudan, Charumathi Sabanayagam, Babatunde L. Salako, Kevin Sandow, Carsten O. Schmidt, Pamela J. Schreiner, William R. Scott, Sudha Seshadri, Peter Sever, Colleen M. Sitlani, Jennifer A. Smith, Harold Snieder, John M. Starr, Konstantin Strauch, Hua Tang, Kent D. Taylor, Yik Ying Teo, Yih Chung Tham, André G. Uitterlinden, Melanie Waldenberger, Lihua Wang, Ya X. Wang, Wen Bin Wei, Christine Williams, Gregory Wilson, Mary K. Wojczynski, Jie Yao, Jian-Min Yuan, Alan B. Zonderman, Diane M. Becker, Michael Boehnke, Donald W. Bowden, John C. Chambers, Yii-Der Ida Chen, Ulf de Faire, Ian J. Deary, Tõnu Esko, Martin Farrall, Terrence Forrester, Paul W. Franks, Barry I. Freedman, Philippe Froguel, Paolo Gasparini, Christian Gieger, Bernardo Lessa Horta, Yi-Jen Hung, Jost B. Jonas, Norihiro Kato, Jaspal S. Kooner, Markku Laakso, Terho Lehtimäki, Kae-Woei Liang, Patrik K.E. Magnusson, Anne B. Newman, Albertine J. Oldehinkel, Alexandre C. Pereira, Susan Redline, Rainer Rettig, Nilesh J. Samani, James Scott, Xiao-Ou Shu, Pim van der Harst, Lynne E. Wagenknecht, Nicholas J. Wareham, Hugh Watkins, David R. Weir, Ananda R. Wickremasinghe, Tangchun Wu, Wei Zheng, Yoichiro Kamatani, Cathy C. Laurie, Claude Bouchard, Richard S. Cooper, Michele K. Evans, Vilmundur Gudnason, Sharon L.R. Kardia, Stephen B. Kritchevsky, Daniel Levy, Jeff R. O’Connell, Bruce M. Psaty, Rob M. van Dam, Mario Sims, Donna K. Arnett, Dennis O. Mook-Kanamori, Tanika N. Kelly, Ervin R. Fox, Caroline Hayward, Myriam Fornage, Charles N. Rotimi, Michael A. Province, Cornelia M. van Duijn, E. Shyong Tai, Tien Yin Wong, Ruth J.F. Loos, Alex P. Reiner, Jerome I. Rotter, Xiaofeng Zhu, Laura J. Bierut, W. James Gauderman, Mark J. Caulfield, Paul Elliott, Kenneth Rice, Patricia B. Munroe, Alanna C. Morrison, L. Adrienne Cupples, Dabeeru C. Rao, Daniel I. Chasman
*These authors contributed equally to this work. These authors contributed equally to this work.

The American Journal of Human Genetics (2018)

Communications

Présentations Orales

Julia pour vos Calculs Scientifiques Intensifs

Mickaël Canouil

Journées nationales du DEVeloppement logiciel de l'Enseignement Supérieur et de la Recherche - JDEV, Bordeaux, France (2015)

Longitudinal Genetic Modelling: Revisiting Associations of SNPs Associated with Blood Fasting Glucose in Normoglycemic Individuals

Mickaël Canouil, Ghislain Rocheleau, Loïc Yengo and Philippe Froguel

Statistical Methods for Post Genomic Data - SMPGD, Lille, France (2016)

Présentations Poster

Application of Joint Models in Genetic Association Studies

Ghislain Rocheleau, Mickaël Canouil, Loïc Yengo and Philippe Froguel

International Genetic Epidemiology Society - IGES, Baltimore, United-States (2015)

Single Nucleotide Polymorphisms Associated with Fasting Blood Glucose Trajectory and Type 2 Diabetes Incidence: A Joint Modelling Approach

Mickaël Canouil, Philippe Froguel and Ghislain Rocheleau

International Genetic Epidemiology Society - IGES, Toronto, Canada (2016)

Single Nucleotide Polymorphisms Associated with Fasting Blood Glucose Trajectory and Type 2 Diabetes Incidence: A Joint Modelling Approach

Mickaël Canouil, Philippe Froguel and Ghislain Rocheleau

4th Symposium European Genomic Institute for Diabetes (E.g.i.d), Lille, France (2016)

Variants Génétiques Associés à la Trajectoire de la Glycémie à Jeun et à l’Incidence du Diabète de Type 2: Une Approche par Modèle Joint

Mickaël Canouil, Philippe Froguel and Ghislain Rocheleau

Congrès Annuel de la Société Francophone du Diabète (SFD), Lille, France (2017)

Récompenses

2015

Allocation de Recherche SFD-Lilly

Société Francophone du Diabète (SFD), Bordeaux, France

“ Détection de Nouveaux Variants Génomiques Simultanément Associés au Glucose Sanguin et à la Survenue du Diabète de Type 2 ”

http://www.sfdiabete.org

Extensions R

snpEnrichment

R package implementing a method for calculating an enrichment statistic of a set of SNP within a GWA signal

Mickaël Canouil and Loïc Yengo (2013)

https://cran.r-project.org/package=snpEnrichment

clere

R package implementing the CLERE methodology

Loïc Yengo, Julien Jacques, Christophe Biernacki and Mickaël Canouil (2014)

https://cran.r-project.org/package=clere